O EDESSA é fruto de muitas orações e incansáveis esforços de pessoas idealistas e bem intencionadas que sonhavam ter uma “Cidade de Refúgio” para seus filhos poderem receber uma educação baseada em princípios bíblico-cristãos. O sonho começou a se concretizar após os líderes da mantenedora terem adquirido este abençoado local.
O primeiro dia de aula foi ministrado pela professora Elza Gutzeit, em caráter de trabalho voluntário, no dia 10 de setembro de 1962. De 1962 aos primeiros meses de 1963 o Educandário esteve sob os cuidados do pastor Edward Kanna, distrital de Colatina.
Em 1963 foi chamado o primeiro professor, o pastor Waldemiro Berger. Em 03 de outubro de 1963 foi realizada no Edessa a inspeção pela Secretaria Seccional de Educação tendo em vista a oficialização do seu curso ginasial, hoje, Ensino Fundamental. A autorização veio através do Ato Nº 11, assinado no dia 18 de dezembro daquele mesmo ano.
O Edessa foi reconhecido definitivamente no dia 6 de abril de 1982.